Theo bảng xếp hạng của Bộ Giáo dục và Đào tạo về kết quả thi đại học năm 2013, Trường THPT chuyên Quang Trung của Bình Phước đã xuất sắc vươn lên vị trí thứ 2 trong danh sách 200 trường THPT có kết quả cao trong cả nước với điểm bình quân 23.19, tăng 11 bậc và tăng 2.57 điểm so với năm 2012.
Cũng trong kỳ thi đại học năm nay Trường THPT chuyên Quang Trung có ba thủ khoa đại học đó là: em Lê Quang Bình, học sinh lớp 12A, thủ khoa khối A, trường Đại học Bách khoa TPHCM, ngành điện – điện tử với tổng điểm là 28 (Toán 9.75, Hóa 9.75 và Lý 8.5); em Trần Thị Mai Thi, học sinh lớp 12E, thủ khoa khối D1, trường Đại học Sư phạm TPHCM với tổng điểm 25.25, làm tròn 25.5 (Toán 8, Anh văn 9.25, Văn 8) và em Lương Trần Anh Duy, lớp 12C, thủ khoa khối B, Đại học Công nghiệp thực phẩm TPHCM với tổng điểm 25 (Toán 9, Sinh 6.75, Hóa 9.25).
Ngoài ra, trường còn có hai Á khoa cùng dự thi vào trường Đại học Sư phạm TPHCM là Nguyễn Ngọc Thu, lớp 12A, Á khoa khối A với tổng điểm 27.7 và Lê Thị Bích Phượng, lớp 12E, Á khoa khối D1 với tổng điểm 24.5.
Tiêu chí để làm căn cứ thống kê là xét những thí sinh tốt nghiệp THPT năm 2013, dự thi đủ 3 môn khối A, A1, B, C và D với những trường phổ thông có từ 30 lượt thí sinh dự thi trở lên (có trên 2700 trường đủ điều kiện thống kê).